Vücuda girip yerleşmiş olan mikropların oluşturduğu vücudumuz için zararlı olan madde grubudur. Vücudumuza giren mikroplar beslenip çoğalırlarken bazı zararlı maddeler meydana getirirler ve bunları kana ve diğer hücrelerimizin çevre sine dökerler.
Toksinler bizim için zehir etkili maddeler olduğundan ateş, titreme, ağrı yaparlar. Fakat vücudumuz bu toksinlere karşı onları zararsız hale getirecek antitoksinleri yapar ve onların daha fazla zarar vermesine engel olurlar.